Η Ηρακλειά έχει δυο βασικούς οικισμούς: Τον Αγιο Γεώργιο στα βόρεια, με το μοναδικό λιμάνι και 4.5 χλμ. νοτιότερα, στους πρόποδες του υψώματος Πάπας, την πρωτεύουσα Παναγιά (ή Πάνω Μερά). Στο δυτικό τμήμα της Ηρακλειάς υπάρχει κι άλλος οικισμός, ο Αγιος Αθανάσιος, με ενδιαφέρουσα αρχιτεκτονική. Σταδιακά, όμως, εγκαταλείφθηκε και αρκετά από τα σπίτια του έχουν μετατραπεί σε στάνες από τους ντόπιους κτηνοτρόφους.