Στη Μύκονο είχε αναπτυχθεί σημαντικός πολιτισμός από τους νεολιθικούς χρόνους -κάτι που αποδεικνύεται από την ανασκαφή του εκτεταμένου οικισμού στη Φτελιά. Είναι της νεότερης νεολιθικής εποχής και βρέθηκε στη μέση της παραλίας της Φτελιάς. Τα παλαιότερα οικοδομήματα χρονολογούνται στην 5η και 4η χιλιετία π.Χ. Στον οικισμό ανακαλύφθηκαν για πρώτη φορά στις Κυκλάδες σημαντικά αρχιτεκτονικά λείψανα -ορθογώνια κτίσματα με μικρούς αποθηκευτικούς χώρους που είχαν χοντρούς τοίχους και ήταν κτισμένα πάνω σε βράχους. Μέσα σ’ αυτά βρέθηκε μεγάλη ποσότητα απανθρακωμένων σπόρων οσπρίων, καθώς και θραύσματα κεραμικών αγγείων με διάφορα σχήματα. Ηρθαν στο φως κόκαλα ζώων και αιχμές βελών από οψιανό που αποδεικνύουν ότι οι κάτοικοι ασχολούνταν με την κτηνοτροφία και το κυνήγι.